Francisco Rufete nació el 20 de Noviembre de 1976 en Benejúzar, Provincia de Alicante, España. Es un futbolista que se desempeña como interior derecho, y su primer club fue el FC Barcelona.
Rufete se inició en las divisiones inferiores del FC Barcelona, llegando a debutar en el último partido de la temporada 1995-1996 con el primer equipo.
Debido a que sus entrenadores no confiaban en él, decidió marcharse para lograr adquirir más experiencia. Su primer traspaso fue al CD Toledo de la Segunda División española.
Tras una muy buena temporada con el equipo de la segunda división, su pase fue comprado por el Real Mallorca, donde no llegó a debutar con el primer equipo y fue transferido nuevamente al Málaga CF.
Con el equipo andaluz logró una excelente temporada en la segunda división, lo que le valió el ascenso a la primera. Tras dos excelentes temporadas con el Málaga, en las que anotó 9 goles en total, fue fichado por otro club español, el Valencia CF.
En el equipo "Che" disputó cinco temporadas, en las cuales sin ser titular indiscutible, logró participar de muchos partidos siendo irregular durante 2005-2006.
A pesar de que nunca fue goleador de algún equipo, sus goles han sido bastante importantes, como por ejemplo el que anotó el 15 de Diciembre del 2001, frente al Espanyol, que le posibilitó al equipo la remontada y victoria del partido. Ese gol fue bastante importante ya que evitó el cese de Rafa Benítez, quien era el entrenador del equipo, y le permitió lograr el título de la liga al Valencia luego de 31 años.
En el verano del 2006, el conjunto del Valencia le otorgó la carta de libertad, permitiéndole ser fichado por el RCD Espanyol.
Con la Selección Nacional de Fútbol de España su debut oficial se produjo el 29 de Marzo del 2000, en un partido que España venció a Italia por dos goles a cero. Desde aquel partido solamente jugó dos más.
Clubes:
Barcelona B (-1996)
CD Toledo (1996-1997)
Real Mallorca (1997-1998)
Málaga CF (1998-2001)
Valencia CF (2001-2006
RC Deportivo Espanyol (2006-)
Títulos (todos con el Valencia CF):
Campeonatos Nacionales:2 Ligas (2001-2002 y 2003-2004)
Copas Internacionales:1 Copa de la UEFA (2004)
1 Supercopa de Europa (2004)